Il museo è allestito al piano terra del Centro visite del Parco fluviale dello Stirone. Si tratta di un'esposizione a prevalente carattere didattico che attraverso diorami, pannelli e altri supporti esplicativi, ricostruisce gli ambienti naturali caratteristici di quest'area geografica. Le vetrine offrono infatti al visitatore una panoramica della varietà ambientale del territorio documentandone la formazione geologica, attraverso l'osservazione dei reperti fossili trovati lungo il torrente Stirone, e le peculiarità della flora e della fauna locali. Il percorso è arricchito da tre acquari che ospitano esemplari della fauna ittica locale e da una stazione interattiva che illustra il territorio fornendo informazioni sulle emergenze naturalistiche, geologico-paleontologiche e storico-architettoniche che introducono alla visita vera e propria.