Il Palazzo del Capitano del Popolo, detto anche Palazzo Nuovo, sorge sul lato orientale della Piazza del Popolo e una grande scala lo unisce al Palazzo del Podestà. Costruito nel 1293, subì diversi rimaneggiamenti: nel 1518 le volte del piano terra furono murate e riaperte in epoca relativamente recente; agli anni ’40 risale invece la porta d’ingresso esterna, in cima alla scalinata. Al piano terra si aprono due grandi archi a tutto sesto, che conducono ai cosiddetti "voltoni", l'atrio, al di sopra dei quali spiccano tre finestre gotiche (trifore sovrastate da motivi timpanati) che danno luce alla Sala del Capitano del Popolo, un grande ambiente che presenta con affreschi del XIV secolo. Nello stesso piano si trova la raccolta archeologica del Museo Civico, che conserva reperti rinvenuti nel territorio di Todi. All’ultimo piano è collocato il Museo Pinacoteca, che si articola in diverse sezioni.